Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mc1rQ01727 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms