Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HmgcrQ01237 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms