Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms