Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms