Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pde1bQ01065 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms