Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms