Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GabpaQ00422 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabpaQ00422 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms