Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IhhP97812 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IhhP97812 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IhhP97812 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IhhP97812 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms