Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smn1P97801 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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