Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms