Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prop1P97458 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prop1P97458 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms