Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms