Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3aP97351 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms