Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp1P97350 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp1P97350 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms