Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms