Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptprn2P80560 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms