Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldb1P70662 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms