Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf11P70378 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf11P70378 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf11P70378 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgf11P70378 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgf11P70378 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms