Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smad1P70340 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms