Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgif1P70284 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms