Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp7P70280 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp7P70280 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms