Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms