Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn5P68500 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms