Protein–RNA interactions for Protein: P68040

Rack1, Receptor of activated protein C kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rack1P68040 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rack1P68040 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rack1P68040 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms