Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tdrd6P61407 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tdrd6P61407 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tdrd6P61407 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd6P61407 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tdrd6P61407 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd6P61407 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms