Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Polr2iP60898 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Polr2iP60898 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Polr2iP60898 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Polr2iP60898 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Polr2iP60898 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms