Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ActbP60710 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ActbP60710 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ActbP60710 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ActbP60710 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ActbP60710 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ActbP60710 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ActbP60710 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ActbP60710 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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