Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hps5P59438 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms