Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphp4P59240 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphp4P59240 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms