Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk2P58801 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms