Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P58686 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P58686 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P58686 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P58686 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P58686 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P58686 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P58686 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P58686 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P58686 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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