Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Setd4P58467 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms