Protein–RNA interactions for Protein: P58064

Mrps6, 28S ribosomal protein S6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps6P58064 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrps6P58064 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms