Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snrpa1P57784 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms