Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmoP56726 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SmoP56726 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SmoP56726 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SmoP56726 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SmoP56726 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms