Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CckbrP56481 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CckbrP56481 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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