Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CartptP56388 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CartptP56388 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CartptP56388 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CartptP56388 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CartptP56388 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CartptP56388 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CartptP56388 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms