Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pex2P55098 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pex2P55098 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms