Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms