Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacnb3P54285 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms