Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CnbpP53996 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms