Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RabggtbP53612 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms