Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e3P52483 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms