Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr3P51678 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr3P51678 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms