Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa-rs12P50716 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa-rs12P50716 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms