Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TspoP50637 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TspoP50637 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TspoP50637 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TspoP50637 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TspoP50637 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TspoP50637 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TspoP50637 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TspoP50637 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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