Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt6aP50446 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt6aP50446 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms