Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LtbrP50284 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LtbrP50284 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms