Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod1P49813 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms