Protein–RNA interactions for Protein: P49117

Nr2c2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c2P49117 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nr2c2P49117 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nr2c2P49117 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms